研究

我的研究方向是生物状态的学习表征:如何从分子层面的测量(变异位点、蛋白质、代谢物)走到表型或疾病进程,以及一个模型需要什么信息,它给出的答案才值得信任。

长期目标是建立以分子为基础、能刻画个体疾病进展的模型,并能在不同人群和生物学尺度之间迁移。

  1. 2025年10月 - 至今
    研究实习生

    Talmo 实验室 · 索尔克生物研究所

    Talmo LabSalk Institute
    • 开发了一种基于蛋白质 Embedding 的关联方法,用 ESM 从基因型预测拟南芥表型。
    • 搭建并验证了作为该方法经典基线的 GWAS → ML 流程。

    导师:Talmo Pereira、Todd Michael。

    ESMGWAS深度学习植物基因组学
  2. 2025年9月 - 至今
    本科生研究员

    Majithia 实验室 · UCSD 医学院

    UC San Diego School of Medicine
    • 在糖尿病预防计划中识别出可区分 20 年糖尿病前期进展轨迹的代谢组学特征。
    • 搭建了覆盖 42,000 个 LC-MS 特征的分析流程;结果在独立组群中得到复现。

    导师:Amit Majithia。

    代谢组学LC-MS糖尿病统计学
  3. 2025年5月 - 2025年10月
    项目学员
    • 在语音记录数据上完成特征工程、类别不平衡校正与多模型评估。
    • 从 400 多名学生中入选前 10,在 AI4ALL 学生研讨会上展示。
    机器学习医疗 AI
  4. 2024年10月 - 2025年10月
    本科生研究员

    DVJ 实验室 · UCSD 生物工程系

    UC San Diego Jacobs School of Engineering
    • 研究肺动脉高压(PAH)成纤维细胞中的力学信号;完成 RNA 提取、qPCR 与基因表达分析。
    • 协助大鼠肺动脉取材,用于胶原检测。

    导师:Daniela Valdez-Jasso。

    生物工程细胞生物学qPCR
  5. 2021年1月 - 2022年10月
    队长兼研究员

    iGEM · 国际遗传工程机器大赛

    iGEM
    • 带领团队、协调各阶段里程碑,并参与湿实验工作。
    • 酿酒酵母中合成类菌孢素氨基酸(MAA),作为可持续的防晒成分。
    • 国际金奖及五项单项奖提名。
    合成生物学领导力iGEM 金奖